سرانجام بعد از چند هفته تعلل و انکار برخی شخصیتهای مذهبی، وزارت کشور با صدور بخشنامهای دستور داد که حرم حضرت معصومه، مسجد جمکران و سایر اماکن زیارتی قم تعطیل شود. در مشهد نیز حرم امام رضا فعلاً به مدت سه روز بسته میشود.
روز شنبه ٢۴ اسفند/١۴ مارس، آستان قدس رضوی اعلام کرد که از همین روز تا دوشنبه ۲۶ اسفند، حرم امام رضا "به طور موقت برای شستشو و نظافت بسته میشود".
در همین روز، حسن روحانی رییس جمهوری اسلامی در مورد ضرورت ایجاد محدودیت در مکانهای زیارتی گفت: "اطمینان دارم مسئولان بقاء متبرکه و حرمهای مطهر در شهرهای مختلف کشور دلسوزی کافی در مورد سلامت مردم دارند و دستورالعمل ستاد مقابله کرونا را در ایام پایانی سال و تعطیلات عید اجرا خواهند کرد".
روحانی افزود: "آرزوی همه ما تشرف به حرمهای مطهر است، اما از هر کجا به آنها متوسل شویم پاسخ ما را خواهند داد. در شرایط امروز توسلها و توجهات باید با رعایت کامل اصول بهداشتی باشد"...
یک روز قبل، حجت الاسلام احمد مروی، نماینده ولی فقیه در استان خراسان رضوی گفته بود: "همه تلاش ما بر آن است تا دلدادگی و توسل مردم به حضرت رضا را از طریق رسانۀ ملی و فضای مجازی بیش از گذشته فراهم کنیم".
به نوشتۀ خبرگزاری ایلنا، شورای شهر مشهد در نامهای محرمانه به استاندار خواهان قرنطینۀ مشهد شده است. با اینحال هنوز برخی روحانیون با بسته شدن اماکن زیارتی مخالفند.
در مورد قم، یونس عالی پور معاون هماهنگی امور زائرین استانداری قم گفت که وزیر بهداشت و رئیس ستاد ملی مبارزه با ویروس کرونا در نامهای به وزیر کشور "خواستار تعطیلی حرم حضرت معصومه، مسجد جمکران و بقاع متبرکه شدهاند" و وزیر کشور نیز با صدور بخشنامهای حکم تعطیلی را ابلاغ کرده است.بدین ترتیب امکان زیارت قم نیز قاعدتاً تا پایان روز بسته خواهد شد.
رادیو بین المللی فرانسه